משאבי WEXAC

דרישות שרתי חישוב עבור מערכת ‏חומרת אשכול משותפת

על מנת להבטיח יעילות מקסימלית בניהול מערכת האשכול המשותפת ובכדי לספק שירותי מחשוב ברמה הגבוהה ביותר ללקוחות האשכול המשותפים, אנו מקפידים על דרישות סף עבור שרתי חישוב שמתווספים ל-WEXAC.

למידע מפורט, אנא עיינו בסעיף מדיניות WEXAC בעמוד המידע שמוקדש להגדרות מדיניות.

קיימים ארבעה סוגים שונים של שרתי חישוב:

  • מעבד אינטנסיבי.
  • זכרון אינטנסיבי.
  • קלט/פלט (I/O) אינטנסיבי.
  • שרת חישוב GPU.

החל בפברואר 2013, דרישות הסף לשרתי חישוב אלה הינן:

  • להבי מחשוב מסוג HP SL230s.
  • חומרה באיכות גבוהה, עם רמת אינטגרציה טובה בכל הקשור לכוח מחשוב, יכולת תרמית, אפשרות מידוף והחלקים בהם נעשה שימוש.
  • מעבדים משושי-ליבות מסוג Intel Xeon E5-2630 בתדר 2.3 גיגה הרץ.
  • 2 גיגה בייט זכרון עבור כל ליבה על פי הדרישות המינימליות, אשר ניתנים להגדלה ל-2 טרה בייט לשרת חישוב זכרון אינטנסיבי יחיד.
  • כונן קשיח SATA או SAS בנפח 500 עד 600 גיגה בייט עבור כל שרת חישוב.
  • יציאת Gigabit Ethernet ו/או יציאת 10 גיגה ביט, או חיבור Infiniband.
  • קישוריות QDR InfiniBand למשימות מסוג MPI, קישוריות Ethernet לעבודות אשכול סטנדרטיות.
  • 3 שנות אחריות.

במידה וברצונכם לרכוש שרתי חישוב ב-WEXAC, אנא צרו צרו קשר עם ואדים מלקין בשלוחה 6078.

סוג מעבד זכרון RAM כונן קשיח מחיר
A (CPU+I/O) Intel E5-2630 x 2, עם 12 ליבות 32
גיגה בייט		 2 SAS 300 x $4,400
(B (CPU Intel E5-2630 x 2, עם 12 ליבות 32
גיגה בייט		 1 SATA 500 x $3,900
(C (GPU 2 Intel E5645 x ו-2 Nvidia Tesla M2050 x (עם 896 ליבות) 48
גיגה בייט		 2 SAS 300 x $8,100
D Mem 128 Intel E5645 x 2, עם 12 ליבות 128
גיגה בייט		 2 SAS 300 x $6,950
E Mem 48 Intel E5645 x 2, עם 12 ליבות 48
גיגה בייט		 2 SAS 300 x $4,500

הדרישות לעיל יבחנו מעת לעת ויעודכנו על פי יחס העלות/ביצועים הטוב ביותר.

מערכת WEXAC כוללת 1,400 ליבות בשרתי חישוב בעלי תצורות מערכת הפעלה ומחסניות יישומים זהות.

רשת וקישוריות

שרתי חישוב ב-WEXAC‏ ‏כוללים הן קישוריות InfiniBand‎ והן יציאות רשת 1/10 גיגה ביט, כאשר שרתי חישוב אחרים מצוידים ביציאות רשת 1 גיגה ביט או 10 גיגה ביט. רשת ה-Ethernet מוקדשת להעברת מידע פנימה והחוצה ממערכת האחסון של WEXAC, והיא מטפלת גם בתפקודים מנהליים שונים. קישוריות ה-InfiniBand משמשת לתקשורת מסוג MPI בין שרתי חישוב. השימוש בשני חיבורים ‏אלה מביא לביצועים מקסימליים באשכול. מערכת WEXAC הינה האשכול הראשון במכון שעושה שימוש הן בקישוריות QDR InfiniBand והן ביציאות Ethernet מסוג 10 גיגה ביט.

אחסון

מערכת עם זמינות וביצועים גבוהים אחראית לשירותי האחסון עבור מערכת WEXAC.

מבנה ספריות האחסון הוא כדלהלן:

  • /home/lab/lab_name - תיקיית אב למעבדה חברה במערכת.
  • /home/lab/lab_name/user_name - תיקיית הבית של משתמש במעבדה שחברה במערכת.
  • /home/user_name - תיקיית הבית של משתמש שאינו חבר במערכת.
  • /apps - יישומים נפוצים, מיקום קבצים בינאריים.
  • /sharedDB - מסד נתונים ציבורי משותף (כגון NT/NR ,PDB). משתמשים רשאים לבקש להוסיף מאגרים למיקום זה.

המלצותינו ביחס למגבלות האחסון ונפחי המקסימום הן כדלהלן:

פרמטר מגבלה הערות
מספר קבצים מקסימלי עבור מעבדה שחברה במערכת 100 מיליון מומלץ לבצע TAR לקבצים עם סיום ביצוע המשימה, על מנת לצמצם ככל האפשר את מספר הקבצים במעבדה שלכם, לחסוך בעלויות גיבוי ולשפר את ביצועי מערכת האחסון
מספר קבצים מקסימלי עבור מעבדה שאינה חברה במערכת 20 מיליון מומלץ לבצע TAR לקבצים עם סיום ביצוע המשימה, על מנת לצמצם ככל האפשר את מספר הקבצים במעבדה שלכם, לחסוך בעלויות גיבוי ולשפר את ביצועי מערכת האחסון
מספר קבצים מקסימלי מומלץ לתיקייה 5 מיליון מספר גדול יותר של קבצים יביא לביצועים לקויים. מומלץ לבצע TAR לקבצים עם השלמת ביצוע המשימה, על מנת שלא לחרוג ממגבלה זו ולחסוך בעלויות גיבוי
גודל קובץ מקסימלי מומלץ 50 גיגה בייט  
מספר תיקיות משנה מקסימלי מומלץ עבור כל תיקייה 100,000 מספר גדול יותר של תיקיות יביא לביצועים לקויים

שרתי חישוב במערכת WEXAC

CN# סוג ליבות מעבד גרפי (GPU) זכרון בגיגה-בייט בעלים
101 IBM 896 ליבות GPU Tesla S2050 24 Public
102-103 HP type C 896 ליבות GPU Tesla S2050 48 Public
104-106 HP type D 12   96 Public
107-121 HP type B 12   24 Public
500-524 HP type B 12   24 מעבדת Fleishman
200-238 Fujitsu 8   16 מעבדת Sorek
070-072 IBM 12   72 מעבדת Lancet
073-075   12   24 מעבדת Hanna
080   12   24 מעבדת Schreiber
081 HP type E 12   48 מעבדת Schreiber
090-091   8   32 מעבדת Tawfik
400-401   8   16 מעבדת Koren
600   8   16 מעבדת Pilpel
610   8   36 מעבדת Sobel
630   8   16 יחידת EM