Department of Molecular Cell Biology

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The multilayered transcriptional architecture of glioblastoma ecosystems
Nomura M., Spitzer A., Johnson K. C., Garofano L., Nehar-belaid D., Galili Darnell N., Greenwald A. C., Bussema L., Oh Y. T., Varn F. S., DAngelo F., Gritsch S., Anderson K. J., Migliozzi S., Gonzalez Castro L. N., ChowdhFury T., Robine N., Reeves C., Park J. B., Lipsa A., Hertel F., Golebiewska A., Niclou S. P., Nusrat L., Kellet S., Das S., Moon H. E., Paek S. H., Bielle F., Laurenge A., Di Stefano A. L., Mathon B., Picca A., Sanson M., Tanaka S., Saito N., Ashley D. M., Keir S. T., Ligon K. L., Huse J. T., Yung W. K., Lasorella A., Verhaak R. G., Iavarone A., Suvà M. L. & Tirosh I. (2025), Nature Genetics, 3406

Deciphering the longitudinal trajectories of glioblastoma ecosystems by integrative single-cell genomics
Spitzer A., Johnson K. C., Nomura M., Garofano L., Nehar-belaid D., Darnell N. G., Greenwald A. C., Bussema L., Oh Y. T., Varn F. S., DAngelo F., Gritsch S., Anderson K. J., Migliozzi S., Gonzalez Castro L. N., Chowdhury T., Robine N., Reeves C., Park J. B., Lipsa A., Hertel F., Golebiewska A., Niclou S. P., Nusrat L., Kellet S., Das S., Moon H. E., Paek S. H., Bielle F., Laurenge A., Di Stefano A. L., Mathon B., Picca A., Sanson M., Tanaka S., Saito N., Ashley D. M., Keir S. T., Ligon K. L., Huse J. T., Yung W. K., Lasorella A., Iavarone A., Verhaak R. G., Tirosh I. & Suvà M. L. (2025), Nature Genetics, 1088

Proteomic and lipidomic analysis of low-density lipoprotein identifies potential biomarkers of early estrogen receptor-positive breast cancer
Abu Mohsen Y., Twitto-Greenberg R., Cohen A., Leichner G. S., Mahler L., Cohen H., Kamari Y., Shaish A., Harari A., Leikin-Frenkel A., Glick Saar E., Geiger T., Malitsky S., Itkin M., Harats D. & Keshet R. (2025), Cancer & Metabolism. 13, 20

Chemoresistome mapping in individual breast cancer patients unravels diversity in dynamic transcriptional adaptation
Dadiani M., Friedlander G., Perry G., Balint-Lahat N., Gilad S., Morzaev-Sulzbach D., Shenoy A., Bossel Ben-Moshe N., Pavlovsky A., Bernstein-Molho R., Domany E., Barshack I., Geiger T., Kaufman B. & Gal-Yam E. N. (2025), Molecular Oncology

Accurate estimation of intraspecific microbial gene content variation in metagenomic data with MIDAS v3 and StrainPGC
Smith B. J., Zhao C., Dubinkina V., Jin X., Zahavi L., Shoer S., Moltzau-Anderson J., Segal E. & Pollard K. S. (2025), Genome Research. 35, 5, p. 1247-1260
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