Pages
פברואר 01, 2010
-
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
Amir Pnueli and the Dawn of Hybrid Systems
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום המשכן ללימודי מוסמכים על-שם דוד לופאטימרצה Oded Maler
CNRS-VERIMAG, University of Grenobleמארגן הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשבצרו קשר -
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
Staged Self-Assembly of DNA and RNA Oligomers: A Route for the Prebiotic Emergence of Nuclei Acids?
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום בניין פרלמן למדעי הכימיהמרצה Prof. Thommaso Bellini
Complex Fluids and Molecular Biophysics Lab. University of Milanמארגן המחלקה לכימיה מולקולרית ולמדע חומריםצרו קשר תקציר Show full text abstract about Ultrashort complementary DNA and RNA oligomers, down to 6 ba...» Ultrashort complementary DNA and RNA oligomers, down to 6 base pairs in length, are found to exhibit nematic and columnar liquid crystal phases, even though such duplexes lack the shape anisotropy required for liquid crystal orientational ordering. These phases are produced whenever fragments of double helices display some - even weak - end-to-end attractive interactions promoting living polymerization into longer polydisperse anisotropic rod-shaped aggregates, which can order. This is the case for self-complementary sequences that, upon hybridizing, form duplexes interacting via the stacking of the terminal nucleobases. This is also the case when duplexes have unpaired overhangs that mutually interact through full or partial pairing. Further mechanisms of self-assembly are active in mixtures of oligonucleotides and flexible polymers of different nature and in random pools of oligomeric sequences. These systems phase separate into a liquid crystal phase rich in well-formed duplexes coexisting with an isotropic phase formed by polymers, single strands and highly defected duplexes. In this way, through a combination of multiple effects, including depletion-type forces and non-equilibrium DNA pairing, the system spontaneously selects well-paired sequences, which are spatially segregated. The result is an efficient spontaneous piling of DNA duplexes in which the terminals of the oligonucleotides are held in physical contact by the collective behavior, a condition favorable for their non-enzymatic ligation.
REFERENCES
Nakata M, Zanchetta G, Chapman BD, Jones CD, Cross JO, Pindak R, Bellini T, Clark NA (2007) Living Polymerization and Liquid Crystal Condensation of 6-20 Base Pair DNA Duplexes. Science 318: 1276-1279
Zanchetta G, Nakata M, Bellini T, Clark NA (2008) Physical Polymerization and Liquid Crystal Crystallization of RNA Oligomers. J. Am. Chem. Soc. 130: 12864-12865
Zanchetta G, Nakata M, Buscaglia M, Clark NA, Bellini T (2008) Liquid Crystal Ordering of DNA and RNA Oligomers with Partially Overlapping Sequences. J. Phys.: Condensed Matter. 28: 494214
Zanchetta G, Nakata M, Buscaglia M, Bellini T, Clark NA (2008) Phase separation and liquid crystallization of complementary sequences in mixtures of nanoDNA oligomers. Proc. Nat. Acad. Sci. 105: 1111-1117
Zanchetta G, Giavazzi F, Nakata M, Buscaglia M, Cerbino R, Clark NA, Bellini T (2010) Right-handed double-helix ultrashort DNA yields chiral nematic phases with both right- and left-handed director twist. Proc. Nat. Acad. Sci. 107: 17497-17502
Bellini T, Zanchetta G, Fraccia T, Cerbino R, Tsai E, Smith GP, Moran MJ, Walba DM, Clark NA, Liquid Crystal Ordering as Evidence for the Structured Self-Assembly of Random-Sequence DNA Oligomers, Proc. Nat. Acad. Sci (to be published)
-
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
Water vapor in the upper troposphere and lower stratosphere: Measurement challenges and recent results
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום בניין משפחת זוסמןמרצה Dr. David W. Fahey
NOAA/ESRL, Chemical Sciences Division, USAמארגן המחלקה למדעי כדור הארץ וכוכבי הלכתצרו קשר -
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
Regulation of endosomal protein trafficking by starvation and its link to Batten disease
More information שעה 13:00 - 13:00מיקום בניין ארתור ורושל בלפר למחקר ביורפואימרצה Niv Dobzinski
Jeffrey Gerst's group, Dept. of Molecular Genetics, WISמארגן המחלקה לגנטיקה מולקולריתצרו קשר -
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
TBA
More information שעה 13:00 - 14:30מיקום מעבדה על-שם דני נ. היינמןמרצה Prof. Eli Waxman מארגן מרכז לאסטרופיסיקה עש נלה וליאון בנוזיוצרו קשר -
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
"A Solar Hydrogen-Producing Bio-Nanodevice that Outperforms Natural Photosynthesis"
More information שעה 13:15 - 13:15מיקום אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידטמרצה Prof. John Golbeck
Department of Biochemistry & Molecular Biology, Pennsylvania State University, University Park PA, USAמארגן הפקולטה לכימיהצרו קשר -
Date:18ראשוןדצמבר 2011הרצאה
Molecular Neuroscience Forum Seminar
More information שעה 15:00 - 16:00כותרת Oxytocin, social behavior and cognitive flexibility in animal models of neurodevelopmental disordersמיקום בניין וולפסון למחקר ביולוגימרצה Bice Chini
CNR Institute of Neuroscience Milan, Italyמארגן המחלקה למדעים ביומולקולרייםדף בית צרו קשר -
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
Bioinformatics Tool of the Month: Analysing Affymetrix microarray data using Partek: From raw data to biological knowledge
More information שעה 10:00 - 12:30מיקום בניין ע"ש משפחת הרי לויןמרצה Dr. Gilgi Friedlander
Bioinformatics unit, Weizmann Institute of Scienceדף בית צרו קשר תקציר Show full text abstract about Bioinformatics Workshop Series 2011-2012 Analysing Affyme...» Bioinformatics Workshop Series 2011-2012
Analysing Affymetrix microarray data using Partek: From raw data to biological knowledge
In the workshop we will learn how to analyze Affymetrix microarray data using the software Partek.
The tutorial will illustrate how to import the data and to do exploratory analysis using PCA and hierarchical clustering.
We will also learn to generate lists of differentially expressed genes and cluster them.
-
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
On the Jacobian conjecture and related problems
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום בניין יעקב זיסקינדמרצה Lenny Makar-Limanov
מארגן הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשבצרו קשר -
Date:19שנידצמבר 2011סימפוזיונים
Faculty of Chemistry Colloquium- Prof. Leeor Kronik
More information שעה 11:00 - 11:00כותרת SPECTROSCOPY WITH DENSITY FUNCTIONAL THEORY: NEW IDEAS FOR A LONG-STANDING PROBLEMמיקום אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידטמרצה Prof. Leeor Kronik
Dept. of Materilas and Interfaces, WISמארגן הפקולטה לכימיהצרו קשר -
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
Natural Vision Improvement
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום בניין לחקר המוח על-שם נלה וליאון בנוזיומרצה Meir Schneider
School for Self-Healing San Francisco, CAמארגן המחלקה למדעי המוחצרו קשר תקציר Show full text abstract about הסיבה העיקרית לראייה לקויה, וגרימת מחלות כרוניות בעיניים, הי...» הסיבה העיקרית לראייה לקויה, וגרימת מחלות כרוניות בעיניים, היא מתח ובעיקר מתח סמוי.
אחת המטרות בעבודתו של מאיר שניידר היא לחשוף את אותו מתח, ובצורה זו להביא לשינוי בדרך ההסתכלות שלנו. לדוגמא: אנשים נוטים לעבוד שעות רבות מול מחשב. מצב זה גורם למאמץ בחלק המרכזי של העין (מקולה) ולהתעלמות מהיקף הראייה, מצב שגורם לצמצום שדה הראייה.
הסתכלות נכונה משלבת בתוכה את המרכיבים השונים של העין והתוצאה היא ביטוי הפוטנציאל הגלום בה. שימוש בצורה הנכונה מביא לאיזון בתוך העין עצמה ושיתוף פעולה מלא יותר בין שתי העיניים.
כאשר מופר האיזון בעיניים נוצר מתח. המתח הוא אחת הסיבות לגרימת מחלות.
בעבודתנו אנו שואפים להגיע להרפיה באמצעות תרגילים שונים. מטרת התרגילים להביא לשינוי בהרגלי הראייה שלנו. נדבך נוסף וחשוב בעבודתנו הוא הקשר בין המוח לעין. אנו "מגייסים" את המוח על מנת ליצור שינוי בעין, כולל שינוי במבנה שלה במידת הצורך.
קיימת קורלציה הדוקה בין הגוף לעיניים. בעיות בזרימת דם, נוקשות בשרירים, בעיות של יציבה ושיווי משקל יכולות לגרום לבעיות עיניים, מהשכיחות ביותר, כמו קוצר ורוחק ראייה ועד למחלות כרוניות כגון: גלאוקומה, קרע ודימום ברשתית וכיוצא בזה.
בהרצאה נדון בסיבות לראייה לקויה והדרכים לשיפורה. נביא מיקרים של מטופלים שכתוצאה מהעבודה בשיטתנו חל שיפור במצבם.
-
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
From sequence to function: How single mutations in the adaptor protein 3BP2 cause the bone disorder Cherubism
More information שעה 14:00 - 14:00מיקום בניין ע"ש מקס ולילאן קנדיוטימרצה Dr. Noam Levaot
Dept. Molecular Cell Biology, WISמארגן המחלקה לאימונולוגיה ורגנרציה ביולוגיתצרו קשר -
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
Ph.D. thesis presentation
More information שעה 14:00 - 14:00כותרת Mechanical and tribological properties of inorganic fullerene-like (IF) nanoparticlesמיקום בניין פרלמן למדעי הכימיהמרצה Ofer Tevet
Ph.D. student of Profs. Reshef Tenne and Hanoch Daniel Wagner, Dept. of Materials and Interfaces, WISמארגן המחלקה לכימיה מולקולרית ולמדע חומריםצרו קשר -
Date:19שנידצמבר 2011הרצאה
מפגשים בחזית המדע
More information שעה 19:15 - 21:00מיקום מכון דוידסון לחינוך מדעימארגן יחידת שוהם במכון דוידסוןדף בית צרו קשר -
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
CERN: The search for ultra massive jets & new physics.
More information שעה 10:00 - 10:00מיקום בניין וולפסון למחקר ביולוגימרצה Prof. Gilad Perez
Department of Particle Physics and Astrophysics, Weizmann Institute of Scienceמארגן המחלקה למדעים ביומולקולרייםצרו קשר תקציר Show full text abstract about After some introduction to the notion of jets in particle ph...» After some introduction to the notion of jets in particle physics I will move to describe the status of jets at the Tevatron and LHC experiments, where jets are copiously produced.
However, due to soft collinear divergencies (a notion that I will try to explain), narrow jets tend to be of low mass.
Of particular interest are those uncommon and unique events where a jet of very large mass is obtained.
The large mass yield a new perturbative scale which provides us with a glimpse into the mechanism of showering in a new kinematical regime. Maybe more importantly, narrow jets of electroweak masses (or above) are the focus of various beyond the standard model (SM) searches related to new form of strong dynamics & extra dimension, supersymmetry and even the celebrated, yet elusive, Higgs boson.
Thus, we discuss some of the theory of massive boosted jets, recent experimental effort at the CDF experiment and a new technique to distinguish between non-SM signals and QCD backgrounds.
-
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
"Harmony of Scattering Amplitudes: From Collider Physics To Supergravity"
More information שעה 10:30 - 12:00מיקום Neve Shalomמרצה ZVI BERN
UCLAמארגן המחלקה לפיזיקה של חלקיקים ואסטרופיזיקהצרו קשר תקציר Show full text abstract about I will show example where modern on-shell methods for unders...» I will show example where modern on-shell methods for understanding scattering are having a real impact, allowing us to perform calculations that would have been extremely difficult if not impossible, even a few years ago. I will present concrete examples from LHC Physics, AdS/CFT and supergravity. -
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
Fourier-Mukai transform and chiral differential operators
More information שעה 11:00 - 11:00מיקום בניין יעקב זיסקינדמרצה Vadim Schechtman
University of Toulouse, Franceמארגן הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשבצרו קשר -
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
"LOCALIZATION IN 3D GAUGE THEORIES"
More information שעה 12:00 - 13:30מיקום Neve Shalomמרצה ITAMAR YAAKOV
CALTECHמארגן המחלקה לפיזיקה של חלקיקים ואסטרופיזיקהצרו קשר תקציר Show full text abstract about In this talk I will give an overview of localization and som...» In this talk I will give an overview of localization and some of its applications for QFTs in three dimensions. I will start by reviewing the localization procedure for N=2 supersymmetric gauge theories in three dimensions on S^3. I will then describe some of the applications to field theory dualities and to holography, and the possibility of extracting information about RG fixed points from the localized partition function. -
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
COGNITIVE DYSFUNCTION AND CHOLINERGIC ALTERATIONS PRIOR TO DOPAMINE LOSS IN MICE OVER-EXPRESSING WILD-TYPE HUMAN ALPHA-SYNUCLEIN
More information שעה 12:15 - 12:15מיקום אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידטמרצה Dr. Iddo Magen
Dept of Neurology, University of California at Los Angelesמארגן המחלקה למדעי המוחצרו קשר תקציר Show full text abstract about Parkinson’s disease (PD) is a characterized, in ad...» Parkinson’s disease (PD) is a characterized, in addition to loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra, by loss of cholinergic neurons in the basal nucleus (Zarow et al., 2003) and pathology of alpha-synuclein, a protein implicated in familial PD, in this region concurrently with pathology of alpha-synuclein pathology in the substantia nigra (Braak et al., 2003), as well as decrease in the activity of choline acetyltransferase, the rate limiting enzyme in the synthesis of acetylcholine (Ziabreva et al., 2006). Mild cognitive deficits are also observed in the early stages of PD (Elgh et al., 2009; Mamikonyan et al., 2009). Mice over-expressing the human wild-type alpha-synuclein under the Thy1 promoter (Thy1-aSyn) present progressive sensorimotor and non-motor behavioral abnormalities reminiscent of the pre-manifest early stages of PD (Magen and Chesselet, ’10) and subsequently exhibit a loss of striatal DA (Lam et al. ’11). We now examined whether these mice also exhibit cognitive deficits in tests sensitive to cholinergic function, and whether they present cholinergic deficits.
Thy1-aSyn mice on a mixed C57BL/6-DBA/2 background presented spatial working memory deficits in the Y-maze which showed progression from 3-4 to 5-6 months and to 7-9 months. Thy1-aSyn mice also showed spatial memory deficits in the novel place recognition test and recognition memory deficits in the novel object recognition test at 4-5 months of age. In a reversal learning task at 4-5 months, Thy1-aSyn mice learned the initial contingency rule as equally well as WT littermates, but were impaired in learning a reversal of this rule, mirroring the cognitive inflexibility displayed by early PD patients in similar tasks. Expression of both proteinase-K resistant and non-resistant alpha-synuclein in the medial septum and the basal nucleus, two major regions of cholinergic input into the forebrain, was increased in Thy1-aSyn mice at 5 months of age, and cholinergic neurons in both regions expressed both human and mouse alpha-synuclein in Thy1-aSyn mice, while endogenous (murine) alpha-synuclein expression was either lower or absent in cholinergic neurons in WT mice. However, morphological features of the cholinergic neurons such as cell body diameter did not change in either the basal nucleus or the septum. Acetylcholine levels decreased by 30% in the cortex of Thy1-aSyn mice at 6 months, further suggesting a link between acetylcholine pathology and the cognitive deficits.
Our data indicate that Thy1-aSyn mice display cognitive dysfunction at an early age, which is associated with decreased acetylcholine levels. As the cognitive tests used are sensitive to cholinergic function (Barker et al., 2008; Yang et al., 2009; Botton et al., 2010), future pharmacological studies will attempt to reverse these deficits using cholinergic agonists and/or acetylcholinesterase inhibitors. A study with an acute nicotine treatment is to be performed soon, to determine whether nicotine can reverse the cognitive deficits, which might point to a causal relation between the cognitive deficits and the compromised cholinergic system. In addition, the cognitive phenotype faithfully reproduces the early cognitive deficits in PD, whereas the lack of any neuropathology in cholinergic neurons suggests that the Thy1-aSyn models mild cognitive deficits rather than dementia, which is mostly associated with a gross neuropathology. Thus, it can serve as a basis for the testing of cognitive enhancers other than cholinergic agents.
-
Date:20שלישידצמבר 2011הרצאה
Dissecting axon-glia interactions - An In-vivo insight into the role of Necl4 in peripheral myelination
More information שעה 12:15 - 12:15מיקום בניין וולפסון למחקר ביולוגימרצה Neev Golan מארגן המחלקה לביולוגיה מולקולרית של התאצרו קשר
