Pages

ספטמבר 12, 2011

  • Date:09שניינואר 2012

    Scripture: A platform for sequencing assay analysis

    More information
    שעה
    09:00 - 10:30
    מיקום
    בניין אולמן למדעי החיים
    מרצהDr. Manuel Garber
    צרו קשר
    תקצירShow full text abstract about Scripture is a method for transcriptome reconstruction that ...»
    Scripture is a method for transcriptome reconstruction that relies solely on RNA-Seq reads and an assembled genome to build a transcriptome ab initio. The statistical methods to estimate read coverage significance are also applicable to other sequencing data. Scripture also has modules for ChIP-Seq peak calling.
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    Surname Leakage from Whole Genome Sequencing Datasets

    More information
    שעה
    10:00 - 11:30
    מיקום
    בניין ארתור ורושל בלפר למחקר ביורפואי
    מרצהDr. Yaniv Erlich
    MIT
    דף בית
    צרו קשר
    תקצירShow full text abstract about Posting annonymous sequening results without identifiers hav...»
    Posting annonymous sequening results without identifiers have become a common practice in large scale sequecning projects. Here, we report a novel risk of surname leakage from whole-genome sequencing datasets. Different from previously described risks, this approach does not require physical access to DNA of the target or prvious leakage of DNA data from the target. Surname leakage relies on bioinformatic profiling of short tandem repeats (STR) on the Y-chromosome and querying massive Web 2.0 genealogical databases. We demonstrate the applicability of the technique by recovering the surname ‘Venter’ from Craig Venter’s genome sequence. We also show that short read datasets are amenable to this technique. According to a conservative estimation, surname recovery would jeopardize 10% of whole genome sequencing datasets of US individuals. Moreover, the combination of a leaked surname with age and state narrows the identity of a sequencing dataset to ≤10 US individuals in most cases. As a remedy, we developed STRANGERS, a tool to mitigate the risk for surname leakage from sequencing datasets. STRANGERS uses a statistical framework that ensures maximal datasharing of Y chrmosome variations while eliminating the risk of surname leakage.
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    Life Sciences Colloquium

    More information
    שעה
    11:00 - 11:00
    כותרת
    Deciphering Mechanisms of Size and Growth Control by Novel Forward Genetic Approaches
    מיקום
    אולם ע"ש דולפי ולולה אבנר
    מרצהProf.Tian Xu
    צרו קשר
    סימפוזיונים
  • Date:09שניינואר 2012

    Faculty of Chemistry Colloquium- Dr. Elisabetta Boaretto

    More information
    שעה
    11:00 - 11:00
    כותרת
    RADIOCARBON DATING: CHALLENGING A 200 YEAR OLD PARADIGM
    מיקום
    אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידט
    מרצהProf. Elisabetta Boaretto
    Kimmel Center of Archaeological Science WIS
    מארגן
    הפקולטה לכימיה
    צרו קשר
    תקצירShow full text abstract about Chronology in archaeology was developed long before radiocar...»
    Chronology in archaeology was developed long before radiocarbon dating was possible. The time sequence was based on detectable changes in the material culture. Even 60 years after the development of radiocarbon dating, this seriation model is widely used. In the last decade a major change has taken place based on integrating field work, quality control on the datable material and improvement in radiocarbon dating analysis. This new approach has resulted in high resolution absolute chronologies that in turn raise fundamental questions about timing of events, reliability of material culture changes and diffusion of ideas, trade and so on.
    סימפוזיונים
  • Date:09שניינואר 2012

    "Energy Efficiency in Transportation: a Key Element of the World's Energy Future"

    More information
    שעה
    13:15 - 13:15
    מיקום
    אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידט
    מרצהDr. Fred Schlachter
    Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley California, USA And American Physical Society
    מארגן
    הפקולטה לכימיה
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    Detecting Dangerous Queries: A New Approach for Chosen Ciphertext Security

    More information
    שעה
    14:30 - 14:30
    מיקום
    בניין יעקב זיסקינד
    מרצהBrent Waters
    University of Texas at Austin
    מארגן
    הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשב
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    Molecular Neuroscience Forum Seminar

    More information
    שעה
    15:00 - 15:00
    כותרת
    ELAV-regulated mRNA processing in synaptic plasticity
    מיקום
    בניין ארתור ורושל בלפר למחקר ביורפואי
    מרצהMatthias Soller
    School of Biosciences Birmingham United Kingdom
    מארגן
    המחלקה למדעים ביומולקולריים
    דף בית
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    מפגשים בחזית המדע

    More information
    שעה
    19:15 - 21:00
    מיקום
    מכון דוידסון לחינוך מדעי
    מארגן
    יחידת שוהם במכון דוידסון
    דף בית
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:09שניינואר 2012

    "התשוקה לרקוד" - תיאטרון בלט פאנוב אשדוד

    More information
    שעה
    20:30 - 20:30
    כותרת
    מיטב קטעי הבלט הקלאסי עם גרסה מיוחדת של" כרמן".
    מיקום
    אודיטוריום מיכאל סלע
    צרו קשר
    אירועי תרבות
  • Date:10שלישיינואר 2012

    "Exploring cellular and molecular mechanisms that shape synaptic function".

    More information
    שעה
    10:00 - 10:00
    מיקום
    בניין וולפסון למחקר ביולוגי
    מרצהDr. Einat Peled
    The university of California Berkley
    מארגן
    המחלקה למדעים ביומולקולריים
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    הרצאה ע"ש פרופ' עמוס דה שליט:

    More information
    שעה
    11:00 - 13:00
    כותרת
    האם ניתן למחשב פיל?
    מיקום
    אודיטוריום מיכאל סלע
    מרצהProf. David Harel
    מארגן
    יחידת שוהם במכון דוידסון
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    Hilbert's irreducibility theorem and Galois representations

    More information
    שעה
    11:00 - 11:00
    מיקום
    בניין יעקב זיסקינד
    מרצהLior Bary-Soroker
    TAU
    מארגן
    הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשב
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    " Understanding the Mechanism of Nitrogen Fixation using Low-Coordinate Iron Complexes"

    More information
    שעה
    11:00 - 11:00
    כותרת
    Department of Organic Chemistry - a departmental seminar
    מיקום
    בניין הלן ומילטון קימלמן
    מרצהProf. Patrick Holland
    Department of Chemistry at University of Rochester
    מארגן
    המחלקה לכימיה מולקולרית ולמדע חומרים
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    Self assembling pore networks: high order curvature driven flows

    More information
    שעה
    11:00 - 11:00
    מיקום
    בניין יעקב זיסקינד
    מרצהNir Gavish
    Michigan State
    מארגן
    הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשב
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    “Multi-dimensional mass spectrometry-based shotgun lipidomics and its applications for biological and biomedical research”

    More information
    שעה
    11:15 - 11:15
    מיקום
    בניין אולמן למדעי החיים
    מרצהProf. Xianlin Han
    Diabetes and Obesity Research Center Sanford-Burnham Medical Research Institute Orlando, FL, USA
    מארגן
    המחלקה למדעי הצמח והסביבה
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    Developmental axon regeneration in the fly

    More information
    שעה
    12:15 - 12:15
    מרצהShir Yaniv
    מארגן
    המחלקה לביולוגיה מולקולרית של התא
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    Optogenetics in Primates: Progress and Opportunities for System Neuroscience and Neuroprosthetics

    More information
    שעה
    12:30 - 12:30
    מיקום
    אולם הרצאות ע"ש גרהרד שמידט
    מרצהDr. Ilka Diester
    Ernst Strungmann Institute, Max Planck, Frankfurt
    מארגן
    המחלקה למדעי המוח
    צרו קשר
    תקצירShow full text abstract about Optogenetics is a versatile technology which is based on lig...»
    Optogenetics is a versatile technology which is based on light sensitive membrane proteins. Those membrane proteins are called opsins. They are derived from microbial organisms which use them to orient themselves towards or away from light of specific wavelengths. Surprisingly, opsins can be safely integrated into the membranes of neurons by using viral vectors or transgenetic techniques, thus making the neurons light-sensitive without causing any aversive reaction. When shining light pulses of different wavelengths on the opsin-expressing neurons, we can either elicit or inhibit an action potential depending on the introduced opsin. Channelrhodopsin-2, for example, is an excitatory opsin which causes neurons to spike under the influence of blue light while Halorhodopsin silences neurons during the presence of yellow light. Although just six years have passed since the term optogenetics was coined, the technique quickly became one of the favorite toys of system neuroscientists. It is already used worldwide in flies, fish and rodents. Now, monkeys bring new requirements to the table. Monkeys are extremely valuable animals and are typically trained for months or years. Hence, the number of experiments with each animal is limited and each experiment has to be well planned and be conducted with exceptional care. The efforts are well justified. Monkeys resemble humans in their cognitive abilities and fine motor skills more than any other standard animal model. They can learn categories, rules and associations, come to decisions, and grasp and manipulate objects in a very human like manner. The neural correlates of these abilities are encoded in areas that are similar to human brain areas. These similarities make monkeys essential for the translation of knowledge, techniques and cures from simpler animal models, such as rodents, to humans. I will discuss recent progress in optogenetics in primates and give a glimpse on putative medical applications with a focus on bidirectional neuroprosthetic devices. Neuroprosthetics is a field which aims to help people who lost control over one or more of their limbs due to a spinal cord injury, a neural disease, a stroke, or an amputation. By reading out signals directly from cortex, decoding them, and using these decoded signals to control a prosthetic device we can bypass the faulty circuits. I will describe the opportunities which optogenetics provide for writing in tactile information. This could allow the users of neural prostheses to not only control a robotic arm but also to feel what they are grasping.
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    "The search for functional elements in the Genome"

    More information
    שעה
    13:30 - 13:30
    מיקום
    בניין וולפסון למחקר ביולוגי
    מרצהDr. Manuel Garber
    מארגן
    המחלקה לאימונולוגיה מערכתית
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    "New Methods Solve the Recalcitrant Structure of Group II Chaperonin"

    More information
    שעה
    14:00 - 14:00
    מיקום
    בניין הלן ומילטון קימלמן
    מארגן
    המחלקה לביולוגיה מבנית וכימית
    צרו קשר
    הרצאה
  • Date:10שלישיינואר 2012

    Gradient Flows on 3-folds with Boundary, Concavity, and Complexity

    More information
    שעה
    16:00 - 16:00
    מיקום
    בניין יעקב זיסקינד
    מרצהGabriel Katz
    MIT
    מארגן
    הפקולטה למתמטיקה ומדעי המחשב
    צרו קשר
    הרצאה

Pages